Des scientifiques israéliens contribuent à une cartographie sans précédent du génome du cancer

Une importante collaboration internationale impliquant des chercheurs israéliens a conclu l’étude et la cartographie « les plus complètes » des génomes cancéreux à ce jour , ce qui a renforcé la compréhension globale du cancer et de ses causes.

Dans l’étude «sans précédent» du projet d’analyse pancréatique des génomes complets (PCAWG), plus de 1 300 scientifiques et cliniciens de 37 pays ont participé, qui ont analysé plus de 2 600 génomes – ou matériel génétique – de 38 types de tumeurs différents pour créer un énorme Ressource du génome du cancer primaire.

Une équipe de scientifiques de la Faculté de médecine de l’Université de Bar-Ilan a participé au projet, communément appelé Projet Pan-Cancer, qui, selon les chercheurs, améliore considérablement «la compréhension fondamentale du cancer et indique de nouvelles directions pour son évolution, diagnostic et traitement ».

Des études antérieures pour cartographier les génomes du cancer se concentraient sur seulement 1% du génome qui code pour les protéines, ce qui, selon les scientifiques, est analogue à la cartographie des côtes des continents du monde. Le projet Pan-Cancer, d’autre part, a profité des nouvelles technologies pour explorer plus en détail les 99% restants du génome, y compris les régions clés qui contrôlent l’activation et la désactivation des gènes, de manière analogue à la cartographie de l’intérieur des continents.

À la fin de l’étude, le projet a publié ses nouvelles conclusions dans 23 articles cette semaine dans Nature et dans des revues affiliées, et a mis à disposition une nouvelle ressource complète pour la recherche sur le génome du cancer.

Le Dr Milana Frenkel-Morgenstern, qui dirigeait l’équipe de chercheurs de l’Université de Bar-Ilan, a déclaré au Jerusalem Post que les « ensembles de mutations somatiques de toutes sortes de mutations somatiques traitées de manière uniforme » de milliers de génomes cancéreux analysés par le projet, combinés avec la plupart des autres génomes de cancer appropriés, ils présentent «une opportunité unique d’établir le répertoire des signatures de mutation et de déterminer leurs activités dans différents types de cancer».

L’impact futur du projet, a-t-il dit, peut être comparable au « séquençage du génome humain en 2000 », une collaboration internationale importante pour séquencer et cartographier tous les gènes humains pour la première fois.

Le groupe de l’Université de Bar-Ilan dirigé par Frenkel-Morgenstern, les seuls représentants d’Israël dans les études génomiques et transcriptomiques du projet, a participé à deux groupes de travail: PAWG-3, chargé d’étudier l’intégration du transcriptome et du génome, et PAWG-6, qui se concentrait sur les transcrits chimériques et les protéines de fusion dans les cancers.

«L’impact pour mon équipe est énorme. Nous recevons une quantité infinie de données sur les génomes du cancer et nous avons déjà exploré les signaux au cours des sept dernières années du projet Pan-Cancer », a déclaré Frenkel-Morgenstern, qui dirige le laboratoire de génomique cancérigène et de bioinformatique des maladies complexes de la faculté de Médecine Azrieli.

L’équipe prévoit également de collaborer avec des collègues du corps professoral et des chercheurs d’autres instituts israéliens pour comprendre la complexité des génomes et des transcriptions du cancer. Les chercheurs ont également l’intention de collaborer avec la Israel Innovation Authority pour établir des installations de calcul haute performance uniques en Israël qui bénéficieront à tous les chercheurs dans ce domaine.

Parmi ses nombreuses conclusions, le projet a rapporté que le génome du cancer est fini et connaissable, bien qu’il soit extrêmement compliqué. La combinaison du séquençage de l’ensemble du génome du cancer avec une série d’outils d’analyse permet aux chercheurs de caractériser chaque changement génétique trouvé dans un cancer et tous les processus qui ont généré les mutations. Les chercheurs ont également déclaré qu’ils étaient sur le point de cataloguer toutes les voies biologiques impliquées, formant une image plus complète de leurs actions dans le génome.

De plus, une nouvelle méthode de «datation au carbone» a permis aux chercheurs d’identifier des mutations qui se produisent des années, parfois des décennies, avant l’apparition d’une tumeur.

Théoriquement, cela peut ouvrir une « fenêtre d’opportunité » pour la détection précoce du cancer.

« Les résultats que nous avons partagés avec le monde aujourd’hui sont l’aboutissement d’une collaboration sans précédent, d’une décennie, qui a exploré l’ensemble du génome du cancer », a déclaré le Dr Lincoln Stein, membre du comité directeur du Pan Project. -Cancer et chef de l’oncologie adaptative de l’Institut de recherche sur le cancer de l’Ontario (OICR).

« Grâce aux connaissances que nous avons acquises sur les origines et l’évolution des tumeurs, nous pouvons développer de nouveaux outils et thérapies pour détecter plus tôt, développer des thérapies plus spécifiques et traiter les patients avec plus de succès. »

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