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Une nouvelle variante du coronavirus, C.1.2, a été détectée en Afrique du Sud et dans d’autres pays, et l’on craint que cette variante soit plus infectieuse et échappe aux vaccins , selon une nouvelle étude pré-imprimée du South African National Institute des maladies transmissibles et la plate-forme d’innovation et de séquençage de la recherche KwaZulu-Natal. L’étude est en attente d’un examen par les pairs.

Les scientifiques ont détecté pour la première fois la variante C.1.2 en mai 2021, constatant qu’elle descendait de C.1, ce que les scientifiques ont trouvé surprenant puisque C.1 a été détecté pour la dernière fois en janvier 2021. La nouvelle variante a « substantiellement muté » par rapport à C.1 et est plus éloigné des mutations du virus d’origine détectées à Wuhan que toute autre variante préoccupante ou variante d’intérêt détectée jusqu’à présent dans le monde.

Bien que détecté pour la première fois en Afrique du Sud, C.1.2 a depuis été détecté en Angleterre, en Chine, en République démocratique du Congo, à Maurice, en Nouvelle-Zélande, au Portugal et en Suisse.

Les scientifiques pensent que le nombre de séquences C.1.2 disponibles peut être une sous-représentation de la propagation et de la fréquence du variant en Afrique du Sud et dans le monde. L’étude a révélé des augmentations constantes du nombre de génomes C.1.2 en Afrique du Sud sur une base mensuelle, passant de 0,2% des génomes séquencés en mai à 1,6% en juin puis à 2% en juillet, de manière similaire aux augmentations observées avec les variantes Beta et Delta en Afrique du Sud.

L’étude a également révélé que la lignée C.1.2 a un taux de mutation d’environ 41,8 mutations par an , ce qui est presque deux fois plus rapide que le taux de mutation global actuel des autres variantes. Les scientifiques ont déclaré que cette courte période d’augmentation de l’évolution a également été observée dans les variantes Alpha, Beta et Gamma, suggérant qu’un seul événement, suivi d’un pic de cas, a entraîné des taux de mutation plus rapides.

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Selon l’étude, plus de la moitié des séquences C.1.2 ont 14 mutations, mais des mutations supplémentaires ont été observées dans certaines des séquences, suggérant que l’évolution au sein de la lignée est en cours.

Environ 52 % des mutations dans la région de pointe des séquences C.1.2 ont été précédemment observées dans d’autres variantes préoccupantes et variantes d’intérêt. Les mutations N440K et Y449H, qui ont été associées à la fuite de certains anticorps, ont également été observées dans les séquences C.1.2. Les scientifiques ont souligné que la combinaison de ces mutations, ainsi que des changements dans d’autres parties du virus, aident probablement le virus à échapper aux anticorps et aux réponses immunitaires, même chez les patients qui ont déjà été infectés par les variantes Alpha ou Beta.

Les scientifiques ont ajouté que davantage de travail est nécessaire pour comprendre l’impact exact de ces mutations et pour voir si elles donnent à la variante un avantage concurrentiel sur la variante Delta.

L’étude intervient alors qu’un médecin turc a signalé qu’une nouvelle variante du coronavirus avait été détectée dans le pays, avec des tests qui ont détecté des mutations qui n’ont pas été trouvées dans les variantes actuelles nommées par l’Organisation mondiale de la santé (OMS).

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Le Dr Lütfi Çamlı a déclaré aux médias turcs qu’en testant la présence de variantes dans toute la Turquie, les médecins ont trouvé une nouvelle variante sans lien avec les autres , qui a atteint un taux compris entre 50% et 100%. province septentrionale de Rize. Çamlı a souligné, cependant, qu’il n’est pas encore clair s’ils ont réellement trouvé une nouvelle variante ou s’il s’agissait simplement du résultat d’une fausse négativité dans les tests PCR.

Le médecin a en outre souligné qu’il est normal que de nouvelles mutations apparaissent lors d’une épidémie et que les mutations récemment découvertes en Turquie pourraient ne pas avoir d’effet grave sur le fonctionnement du virus. Çamlı a appelé à des recherches plus poussées et à ce que les résultats des tests génomiques d’échantillons prélevés à Ankara soient rendus publics.

Jusqu’à mercredi dernier, l’OMS avait identifié quatre variantes inquiétantes et quatre variantes d’intérêt . Jeudi dernier, le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) avait identifié cinq variantes préoccupantes et six variantes intéressantes. D’autres variantes ont été désignées pour un suivi ultérieur.



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